2. Μονάδα Α – Σχεδιασμού, Προγραμματισμού και Εξειδίκευσης Δράσεων και Συνολικής Παρακολούθησης
3. Μονάδα Β1 – Υποστήριξης Ένταξης και Εφαρμογής Δράσεων Α/θμιας και Β/θμιας Εκπαίδευσης
6. Μονάδα Γ – Οργάνωσης και Διοικητικής Υποστήριξης
7. Μονάδα Δ – Διαχείριση Οικονομικών και Ειδικός Λογαριασμός
8. Μονάδα Ε – Πληροφορικής, Ηλεκτρονικής Υποστήριξης και Εφαρμογών